ต่อมาในช่วงรัชกาลพระบาทสมเด็จพระปกเกล้าเจ้าอยู่หัว มีบันทึกอยู่ในจดหมายเหตุระบุนามเจ้าอาวาส วัดพุทไธศวรรย์ ระหว่าง พุทธศักราช ๒๔๖๐-๒๔๗๕ จำนวน ๓ รูป คือ เจ้าอธิการฟัก เจ้าอธิการโป๋ และพระครูสมุห์สังวร ต่อจาก พ.ศ. ๒๔๗๕ ก็ไม่ปรากฏหลักฐานนามเจ้าอาวาสอีกจนถึงปีพุทธศักราช ๒๔๙๑ จึงปรากฏนามเจ้าอาวาสตามลำดับดังนี้
๑. เจ้าอธิการคง เป็นเจ้าอาวาส ระหว่าง พ.ศ. ๒๔๙๑ - ๒๔๙๓
๒. พระครูสาธุกิจโกศล (ยอด) เป็นเจ้าอาวาส ระหว่าง พ.ศ. ๒๔๙๓ - ๒๔๙๗
๓. พระครูภัทรกิจโสภณ (หวล) เป็นเจ้าอาวาส ระหว่าง พ.ศ. ๒๔๙๘ - ปัจจุบัน
ลำดับเจ้าอาวาส
พระสงฆ์ผู้ดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาสวัดพุทไธศวรรย์ เท่าที่มีหลักฐานปรากฏ ตั้งแต่อดีตจนปัจจุบันมีดังนี้
๑. พระอาจารย์ฟัก เดิมอยู่วัดธรรมิกราช ต.ท่าวาสุกรี อ.พระนครศรีอยุยา จ.พระนครศรีอยุธยา ได้ย้ายมาดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาสและได้รับแต่งตั้งเป็นพระครูสัญญาบัตร ในรัชกาลที่ ๕ (ไม่ปรากฏราชทินนาม) ท่านเป็นผู้บอกบุญเรี่ยไรซ่อมกำแพงแก้วด้านหน้าวัด เมื่อปีจอ พ.ศ. ๒๔๔๑ และทำการซ่อมแซมพระพุทธปรางค์
๒. พระอาจารย์อิน ได้รื้อย้ายสร้างหอระฆังขึ้นใหม่ ซึ่งเดิมอยู่ภายในกำแพงแก้ว
๓. พระสมุห์วอน ไม่ปรากฏหลักฐานว่าเป็นฐานานุกรม ขจองท่านผู้ใด
๔. พระครูอุปเทศธรรมวินัย (ชม พรหมโชติ) ดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาส เมื่อประมาณ ๕๐ กว่าปีมาแล้ว และดำรงตำแหน่งเจ้าคณะตำบลสำเภาล่ม อำเภอพระนครศรีอยุธยา จังหวัดพระนครศรีอยุธยา อีกตำแหน่งหนึ่ง ท่านเป็นผู้บูรณะซ่อมแซมผนังอุโบสถและโบราณสถาน รวมทั้งอาคารต่าง ๆ ภายในวัดให้มีสภาพสมบูรณ์แข็งแรงมาจนถึงปจัจจุบัน
๕. พระอธิการสนธิ์
๖. พระอาจารย์คง ท่านดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาส และเจ้าคณะตำบลสำเภาล่มอีกตำแหน่งหนึ่ง
๗. พระครูสาธุกิจโกศล (ยอด มนิสสโร) ดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาสประมาณปี พ.ศ. ๒๔๙๓ - ๒๔๙๕ และดำรงตำแหน่งเจ้าคณะตำบลอีกตำแหน่งหนึ่งด้วย
๘. พระครูภัทรกิจโสภณ (หวล ภูริภทโท) ดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาสตั้งแต่วันที่ ๓๐ ธันวาคม พ.ศ. ๒๔๙๘ ถึงปัจจุบัน และดำรงตำแหน่งเจ้าคณะตำบลตั้งแต่วันที่ ๓๑ ธันวาคม พ.ศ. ๒๔๙๙ อีกตำแหน่งหนึ่งด้วย ท่านเป็นผู้นำในการบูรณะซ่อมแซมโบราณสถาน โบราณวัตถุภายในวัดให้มีสภาพสวยงามมั่นคงแข็งแรง อุโบสถ วิหาร พระพุทธรูปภายในพระระเบียงรอบองค์พระปรางค์ พระพุทธรูปภายในวิหารต่าง ๆ หลายหลังเท่าที่สามารถทำได้ นอกจากนี้ท่านยังได้ทำการพัฒนาปรับปรุงพื้นที่ว่างภายในวัดให้เป็นระเบียบสวยงาม เช่น จัดทำสวนดอกไม้ประดับ และปลูกสวนป่าตามโครงการของสมเด็จพระนางเจ้าพระบรมราชินีนาถ เป็นต้น นับว่าท่านพระครูภัทรกิจโสภณ เป็นกำลังสำคัญในการทะนุบำรุง และปรับปรุงฟื้นฟูวัดพุทไธศวรรย์ให้มีความเจริญ รุ่งเรือง และเป็นที่รู้จักของประชาชนทั่วไป